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南昌市第一醫院胃腸外科傳承于上世紀五十年代，秉承優良傳統，繼承和發揚了精湛的醫療技術，學術風氣濃厚。科室著眼國內先進、走專科化發展的方向，在胃腸、肛門外科、疝及腹壁外科等多個專業領域均取得了好成績，在省內學術界享有盛譽。
胃腸外科是醫院的重點優勢學科與重點發展專科，技術力量雄厚，科室擁有主任醫師1名，副主任醫師6名，主治醫師1名，住院醫師3名，碩士研究生3名，是集醫療、教學、科研為一體的專業學科，我科承擔省內多所高校本科教學任務，并主持完成多項省科技廳、衛生廳，市科技局研究課題，發表論文幾十篇。
科室團隊一直堅持腹腔鏡微創治療理念為指導的發展模式，同時致力于胃癌、結直腸癌等腫瘤規范化治療體系以及MDT體系的建立，科室目前已經達到90%胃腸手術腹腔鏡微創治療，腹腔鏡下開展的胃癌D2標準的根治術、直腸癌TME技術下的根治術、低位/超低位直腸癌保肛治療、基于膜解剖的結腸癌根治術取得了非常滿意的療效，為大量病人解除了病痛。在代謝外科理念指導下，引進GBP手術，在治療Ⅱ型糖尿病、肥胖減重方面取得療效。使我院胃腸外科的治療水平站在了南昌地區的領先行列。
在肛腸治療領域，在省內率先引進痔上黏膜環切釘合術（PPH）技術，為Ⅲ、Ⅳ度混合痔的治療帶來了新的理念，并主持完成了該項目在省衛生廳的課題研究且全省推廣，至今治療病例已數千例。
科室一直在疝專科研究領域跟隨國內國際先進水平同步發展，早期就開展了腹腔鏡下采用TAPP、TEP、IPOM等技術微創治療各種腹壁疝，并且以Lichtenstain技術、腹膜前間隙修補技術（UHS）針對高齡患者開展局麻下的疝修補術，成為了我科重要特色。我科是江西省腸外瘺及營養學的領先學科，在治療各種復雜原因導致的腸外瘺及場內、腸外營養支持治療上有著深入的探索和豐富的經驗。